По небольшому столбику ткани, полученному при биопсии печени, часто можно судить об изменениях во всём органе. При холестазе, стеатозе, вирусном гепатите, ретикулёзе поражение печени имеет диффузный характер. Это также относится к большинству циррозов, однако при крупноузловом циррозе ткань печени, полученная при биопсии, может оказаться неизменённой. Гистологическая картина цирроза печени при исследовании биопсированной ткани меняется при сопутствующем остром или хроническом гепатите.
Биопсия не всегда позволяет диагностировать очаговое гранулематозное поражение печени (например, саркоидоз), опухоли и абсцессы, однако при проведении серийных срезов диагноз, как правило, возможен. Основными причинами неинформативности биопсии являются малые размеры полученного образца ткани, отсутствие в нём портальных трактов, очаговость поражения печени и особенно неопытность морфолога. Диагностическая ценность биопсии может быть увеличена взятием трёх образцов путём последовательного изменения направления иглы без полного извлечения её.
Операционная биопсия может создать неправильное представление о печени в целом, так как под капсулой содержится большее количество фиброзной ткани. При операционной биопсии также возможны артефакты в виде участков, лишённых гликогена, кровоизлияний, инфильтрации нейтрофилами и очагового некроза. Они обусловлены преимущественно механическим повреждением, а также циркуляторными нарушениями и гипоксией, которые наблюдаются при операциях.
| 
